按照过往的经验，人类婴儿在初生的几天内，更喜欢看从生物学上讲有意义的运动，而并非在生物学没有意义的运动，这是很多其他物种也都具有的一个能力。如今，学者们展示的对患有自闭症的两岁儿童所做的研究表明，这些儿童不朝生物运动的点光源显示(由玩“躲猫猫”等简单游戏的动画人物组成，标注出“运动点”)看，但却被动画片的其他某些特征所吸引(例如人物的颜色，线条的粗细等)，而这些特征又是没有自闭症迹象的儿童所忽略的。这种行为差异可能反映了自闭症患者大脑功能发生的变化，并且还可能导致自闭症患者会有的在社会互动方面的困难。
目前已知的可能与自闭症有关的脑部区域。
自闭症儿童的大脑中通常会出现胼胝体异常的状况。
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