因为淋球菌最易侵犯泌尿生殖器官柱状上皮与移行上皮形成的粘膜，所以淋菌性尿道炎、前庭腺炎与肛门炎多见；由复层鳞状上皮构成的阴道粘膜不易被淋球菌侵犯，所以淋球菌阴道炎较少见。其临床表现如下：
（1）淋菌性尿道炎与尿道旁腺炎
一般在性交后2～5日出现尿痛、尿急、尿烧灼感等症状，尿道口红肿充血，挤压尿道旁腺，有脓性分泌物溢出。
（2）淋菌性前庭腺炎
前庭腺有明显的红、肿、热、痛等急性炎症反应，严重者可形成前庭腺脓肿。
（3）淋菌性子宫颈内膜炎
子宫颈管内膜为淋球菌最易隐藏之处，患者子宫颈充血、水肿、触痛，常发现脓性白带增多。
（4）淋菌性盆腔炎
系指一组疾病，包括急性输卵管炎、子宫内膜炎、输卵管卵巢脓肿、盆腔脓肿及腹膜炎等。多数急性输卵管炎患者可无症状，只是月经周期延长，月经来潮时血量增多，月经过后即可产生高热、寒颤、头痛、恶心、呕吐及食欲不振等；其他症状包括：两下腹部疼痛，有明显压痛，一侧较重。妇科检查可见尿道、尿道旁腺、前庭腺及子宫颈处有脓性分泌物，双侧附件增厚、压痛。如有输卵管卵巢脓肿，于附件处或子宫后穹窿处触到肿物，并有触痛及波动感。如输卵管脓肿破裂，则可引起腹膜炎，甚至中毒性休克。
上述症状与体征只能提示为一急性炎症，没有特异性，故不能定性。单凭这些症状与体征往往不易与急性阑尾炎、异位妊娠、卵巢囊肿扭转或破裂等妇产科急腹症相鉴别，还要靠涂片及培养查菌来确定诊断。
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