内分泌因素在阴茎勃起的调节中起着重要的作用，因此临床上许多内分泌疾病都伴有较高的阳痿发生率。除了性腺功能减退等直接影响雄激素水平的疾病外，以下疾病亦常伴发阳痿。
甲状腺疾病
无论甲状腺功能亢进还是减退都可以对勃起功能造成不利的影响。对于甲状腺功能亢进，其血液中的雌激素和雄激素结合球蛋白水平增高，这样在游离睾酮减少和雌激素升高的双重作用下，性功能受到广泛影响。有报道称甲状腺功能亢进患者中性欲低下的发生率为71﹪，阳痿的发生率为56﹪，有的患者甚至可以出现乳房女性化现象。
甲状腺功能减退者血液中雄激素结合球蛋白降低或正常，但总睾酮的浓度降低，而且睾酮代谢也发生异常，不再转变为雄甾烯酮，从而影响患者的勃起功能。
高催乳素血症
由于本病不如糖尿病、甲状腺功能亢进等疾病常见，故当这样的患者以阳痿就诊时，医生或患者均可能认为阳痿的发生是由于年龄或心理等因素引起，从而不易作出正确的病因判断。
通常认为高催乳素血症导致阳痿的发生是通过对下丘脑-垂体-睾丸轴的影响导致睾酮水平下降所致，但给予睾酮替代治疗后其勃起功能似乎不能得到满意的改善，给予溴隐亭降低催乳素的水平后其勃起功能可以得到迅速纠正，因此本病除了影响下丘脑-垂体-睾丸轴外，可能还存在某种中枢机制。
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